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週次 |
日期 |
單元主題 |
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第1週 |
09/12 |
課程介紹
Molecular marker development and SNP genotyping technology（董致韡)
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第2週 |
09/19 |
簡單重複序列 (SSR) 基因型定型分析實驗（胡凱康） |
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第3週 |
09/26 |
1. KASP SNP genotyping hands-on experiment
2. Introduction of RAD/GBS system (董致韡) |
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第4週 |
10/03 |
Linux 系統操作簡介(陳凱儀) |
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第5週 |
10/10 |
國慶日放假 |
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第6週 |
10/17 |
高通量核酸定序資料實作 (陳凱儀) |
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第7週 |
10/24 |
GATK best practice workflow (胡凱康) |
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第8週 |
10/31 |
R/ variant annotation -- VCF format (胡凱康) |
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第9週 |
11/07 |
「綜合品質管理」討論與實作 (胡凱康) |
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第10週 |
11/14 |
de novo read assembly & SNP calling (Stacks) (陳凱儀) |
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第11週 |
11/21 |
Construction of a genetic map (黃永芬) |
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第12週 |
11/28 |
Marker order in a linkage group (travelling salesman problem; TSPmap) (陳凱儀) |
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第13週 |
12/05 |
QTL mapping I (R/qtl) (黃永芬) |
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第14週 |
12/12 |
QTL mapping II (R/qtl) (黃永芬) |
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第15週 |
12/19 |
QTL mapping -- Oral presentation (R/qtl) (黃永芬) |
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第16週 |
12/26 |
GWAS I (董致韡) |
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第17週 |
01/02 |
GWAS II (董致韡) |